Benmargsaspirat:
Benmargsbiopsi:
Blod:
Lymfeknute:
Solid svulst:
Bestilling av transportmedium:
Send mail til Seksjon for kreftcytogenetikk cytogenetikk@radiumhospitalet.no
Oppgi følgende:
Oppbevaring av McCoy- og RPMI-transportmedium:
*regnes fra dato oppgitt på rør/transportbeholder
Oppbevaring og forsendelse:
Forsendelsesadresse:
Oslo universitetssykehus HF
Radiumhospitalet
Avdeling for patologi
Seksjon for kreftcytogenetikk
Ullernchausséen 70
0379 Oslo
Karyotypering:
| Prøvemateriale | CITO-prøver (dager) | Rutineprøver (dager) |
Benmarg Blod Lymfeknute | 12 | 21 |
| Solid svulst | 21 | 28 |
FISH:
| Prøvemateriale | CITO-prøver (dager) | Rutineprøver (dager) |
Benmarg Blod Lymfeknute | 10 | 21 |
| Solid svulst | 14 | 21 |
aCGH:
| Kategori | Dager |
| ABL-klassefusjon for A2G pasienter ≤18år | 14 |
| ABL-klassefusjon for A2G pasienter ≥18år | 28 |
CNA-profil og genetiske avvik for A2G-pasienter | 28 |
| Andre leukemier/neoplasier | 28 |
Karyotypering:
Karyotypering er en fotografisk fremstilling og systematisering av alle kromosomene i en celle under celledeling (metafase). Karyotypering benyttes for å påvise numeriske og/eller strukturelle kromosomavvik.
FISH:
Fluorescens in situ hybridisering (FISH) er en målrettet molekylærgenetisk metode som brukes til å påvise og lokalisere spesifikke DNA-sekvenser i interfasekjerner eller metafasekromosomer. Metoden benytter fluorescensemerkede prober som binder seg komplementært til målsekvenser slik at genomiske avvik kan visualiseres i mikroskop.
Resultatene tolkes basert på fargesignalmønster og interne cutoff-verdier. FISH benyttes for å påvise numeriske og strukturelle avvik, bla delesjoner, duplikasjoner, amplifikasjoner, translokasjoner og/eller fusjoner på kromosomer.
aCGH:
Array-basert komparativ genomisk hybridisering (aCGH) er en molekylærgenetisk metode som brukes til å påvise relative kopitallsendringer sammenlignet med en referanse. Tumor-DNA og referanse-DNA merkes med ulike fluorescerende farger og hybridiseres til en mikroarray/matrise med genomiske prober. Ratio mellom signalstyrke forteller om kopitallsforholdet mellom referanse og prøvemateriale. Seksjonens microarray-plattform har i tillegg til oligoprober også SNP-prober. SNP-array benyttes for å vurdere hvor mange alleler som er tilstede i en genomisk region og benyttes blant annet for å vurdere dupliserte kloner og kopinøytralt tap av heterozygositet (CN-LOH). aCGH benyttes for å påvise kopitallsforandringer, som delesjoner, duplikasjoner og/eller amplifikasjoner over hele genomet.
Overleger med spesialistgodkjenning innen medisinsk genetikk, patologi, onkologi eller hematologi og spesialingeniører med godkjenning tolker funnene i samarbeid med labingeniører og besvarer resultatene i tekstformat.
For det humane genom gjelder en absolutt normalverdi på 46 kromosomer og et kopitall på 2. Et hvert avvik fra dette vil utgjøre et avvik. Enkelte har medfødte genetiske endringer som gir et annet kromosomoppsett.
Karyotypering:
ISCN-kriterier benyttes for å definere klonale avvik.
FISH:
Internt beregnede cutoff-verdier på interfasekjerner der det tas høyde for tilfeldige oppståtte artefakter. Skiller normaltilfeller fra avvik.
aCGH:
Kopitallsvarianter skåres i henhold til internasjonale retningslinjer for diagnostiske laboratorier.
Karyotypering:
Karyotypering er en helgenomanalyse som kan oppdage numeriske eller strukturelle kromosomavvik større enn 5-10 Mb.
FISH:
FISH er en målrettet analyse som benyttes til påvisning/fravær av spesifikke avvik og er basert på en cutoff-verdi.
aCGH:
aCGH er en helgenomanalyse for deteksjon av numerisk ubalanse i genomet. Kopitallsvarianter rapporteres dersom 5Mb eller større. Metoden er sensitiv ned mot 20 % tumorinnhold.
Seksjon for kreftcytogenetikk ble akkreditert 14.03.2025 av Norsk Akkreditering ihht NS-EN ISO 15189 (TEST 332). Akkrediteringen gjelder alle FISH-analyser.
Akkrediteringsmerket er ikke angitt på seksjonens svarrapport. Seksjonen arbeider mot akkreditering av flere analyser og akkrediteringsmerket vil bli å finne på svarrapporten når dette er på plass.



